107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1545 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 187 aa  240  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  36.53 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  28.07 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 199 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.27 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  29.87 
 
 		 266 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  29.77 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  23.45 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  21.33 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  30.19 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  26.09 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  24.68 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  27.06 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  23.98 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  22.29 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  26.52 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>