More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1334 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  97.34 
 
 
188 aa  348  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  85.48 
 
 
187 aa  328  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  92.02 
 
 
187 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  92.02 
 
 
187 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  92.02 
 
 
187 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  82.42 
 
 
192 aa  311  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  79.46 
 
 
192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  86.17 
 
 
192 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  86.17 
 
 
187 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  75.94 
 
 
199 aa  301  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  77.42 
 
 
187 aa  300  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  75.66 
 
 
189 aa  297  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  77.54 
 
 
190 aa  297  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  80.75 
 
 
189 aa  296  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  76.88 
 
 
191 aa  296  9e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  83.51 
 
 
187 aa  296  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  73.3 
 
 
191 aa  294  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  74.19 
 
 
193 aa  294  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  80.75 
 
 
192 aa  292  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  74.6 
 
 
194 aa  292  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  73.66 
 
 
189 aa  292  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  75.27 
 
 
191 aa  292  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  79.14 
 
 
189 aa  291  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  79.14 
 
 
189 aa  290  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  74.19 
 
 
193 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  81.18 
 
 
189 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  74.73 
 
 
198 aa  288  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  73.8 
 
 
189 aa  287  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  72.19 
 
 
190 aa  286  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  73.12 
 
 
189 aa  283  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  71.58 
 
 
191 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  77.78 
 
 
184 aa  279  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  73.89 
 
 
196 aa  279  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  79.79 
 
 
189 aa  275  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  70.05 
 
 
190 aa  271  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  67.91 
 
 
190 aa  269  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  81.42 
 
 
199 aa  266  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  64.13 
 
 
186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  63.98 
 
 
189 aa  247  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
178 aa  238  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
178 aa  238  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 
180 aa  237  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.67 
 
 
183 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
180 aa  234  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  61.67 
 
 
183 aa  232  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  61.41 
 
 
185 aa  232  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  232  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  58.76 
 
 
191 aa  232  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  59.55 
 
 
181 aa  231  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  61.41 
 
 
185 aa  232  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  231  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  230  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  61.96 
 
 
185 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  229  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.1 
 
 
179 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 
179 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
178 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  228  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  228  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.95 
 
 
180 aa  228  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  228  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.98 
 
 
179 aa  228  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  60.11 
 
 
197 aa  227  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  60.11 
 
 
180 aa  228  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  228  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  227  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  227  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  227  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
185 aa  227  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  227  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  227  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  227  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  57.22 
 
 
180 aa  226  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  226  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 
182 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
220 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  224  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  57.22 
 
 
184 aa  225  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  57.3 
 
 
243 aa  224  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0340  50S ribosomal protein L5  56.11 
 
 
181 aa  224  4e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>