More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1284 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 444 aa  846    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 462 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3195  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2964  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.413021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.91 
 
 		 522 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.41 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.05 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.67 
 
 		 485 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 484 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.78 
 
 		 522 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.22 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4579  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 		 528 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 763 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.33 
 
 		 534 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.92 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.57 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.71 
 
 		 520 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 490 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 		 475 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 511 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 504 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.69 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 468 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  31.79 
 
 		 582 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 518 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  31.79 
 
 		 582 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 529 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.26 
 
 		 522 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  31.34 
 
 		 554 aa  172  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.72 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  31.48 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.46 
 
 		 520 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 		 521 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 494 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 504 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  34.52 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 		 527 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.72 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 553 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 		 516 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  36.5 
 
 		 582 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.94 
 
 		 537 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 452 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  30.86 
 
 		 582 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.11 
 
 		 539 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 532 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37 
 
 		 531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0658046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.46 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  38.08 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.62 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.19 
 
 		 498 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 		 508 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
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NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 487 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
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NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 503 aa  163  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 489 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
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NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  37.9 
 
 		 450 aa  162  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  29.78 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
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NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  34.58 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 519 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_0420  major facilitator superfamily permease  30.56 
 
 		 608 aa  161  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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