34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1238 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1026    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  41.33 
 
 		 527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  40.96 
 
 		 529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  40.96 
 
 		 529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  33.94 
 
 		 540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  29.45 
 
 		 528 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  29.02 
 
 		 580 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  28.65 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  27.36 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  27.07 
 
 		 588 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  25.56 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  27.93 
 
 		 655 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  28.16 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  24.95 
 
 		 517 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  24.95 
 
 		 517 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  24.39 
 
 		 517 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  29.32 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  28.48 
 
 		 413 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  27.85 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  27.85 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  25.89 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  25.89 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  25.89 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  26.86 
 
 		 499 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  22.82 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  24.8 
 
 		 783 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  27.4 
 
 		 768 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  26.15 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  26.34 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  26.84 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  23 
 
 		 623 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  24.85 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  32.37 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  26.54 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>