117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1163 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  73.89 
 
 
188 aa  249  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  38.2 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
187 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
208 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
383 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
234 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
213 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
224 aa  61.6  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 
192 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
237 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
213 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
173 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
193 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.48 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
224 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
215 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  32.06 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.57 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  25.93 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
213 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  24.81 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
200 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 
215 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 
266 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
188 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
210 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.05 
 
 
211 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.49 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  29.09 
 
 
189 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 
201 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>