More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1114 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  100 
 
 		 637 aa  1286    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  56.43 
 
 		 637 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  35.77 
 
 		 647 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  35.77 
 
 		 647 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  35.77 
 
 		 647 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  29.09 
 
 		 608 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  29.09 
 
 		 608 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  29.09 
 
 		 608 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  29.33 
 
 		 617 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  29.33 
 
 		 617 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  29.65 
 
 		 638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  25.06 
 
 		 637 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  25.3 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  25.3 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  25.3 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  29.72 
 
 		 426 aa  110  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  28.54 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 721 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  29.01 
 
 		 721 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 737 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  26.26 
 
 		 708 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  24.24 
 
 		 498 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  24.43 
 
 		 701 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  24.43 
 
 		 684 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  23.46 
 
 		 675 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  35.57 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  31.08 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 295 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 295 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  33.5 
 
 		 295 aa  80.1  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.61 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  29.89 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.23 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  34.23 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  24.78 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  32.07 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.3 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.17 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  31.5 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  32.2 
 
 		 317 aa  76.6  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.64 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  35.26 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.22 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.15 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.22 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.15 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.06 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  33.33 
 
 		 295 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 312 aa  73.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  31.18 
 
 		 308 aa  73.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  27.06 
 
 		 307 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 295 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 282 aa  73.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  32.16 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  29 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.22 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  32.3 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  28.07 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  28.68 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.75 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  24.25 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  26.71 
 
 		 400 aa  70.5  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.06 
 
 		 307 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.9 
 
 		 400 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  30.48 
 
 		 324 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.6 
 
 		 292 aa  70.5  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  23.87 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  31.42 
 
 		 307 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  29.68 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.92 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  32.79 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  32.29 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.99 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  29.76 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  30.05 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  31.84 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  30.12 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2861  phage integrase family protein  38.96 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>