More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1113 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  100 
 
 		 364 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  60.87 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  39.04 
 
 		 349 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  39.04 
 
 		 349 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  39.04 
 
 		 349 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  38.6 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  38.6 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  38.6 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  37.96 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  37.96 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  37.96 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.25 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  32.52 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.65 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25.66 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25.66 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.82 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.79 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.15 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.7 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.37 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.38 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  30.12 
 
 		 299 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.91 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.96 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.92 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.95 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.01 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  30.37 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.39 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  25.38 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.82 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 310 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.2 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.71 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00070  putative site-specific recombinase  24.7 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  31.67 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.32 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.27 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  26.67 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 295 aa  106  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.88 
 
 		 296 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  22.99 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.29 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.59 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  28.49 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  25.16 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  32.98 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.81 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  30.48 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  27.63 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  28.86 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 306 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  24.86 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.94 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  32.06 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.27 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.04 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  26.63 
 
 		 298 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  27.84 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.83 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.63 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.07 
 
 		 297 aa  99.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.67 
 
 		 299 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  25 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.49 
 
 		 295 aa  99.4  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.83 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.37 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.67 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.67 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>