294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1093 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
386 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  43.48 
 
 
323 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  44.35 
 
 
379 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  38.95 
 
 
370 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  37.4 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  36.24 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  36.86 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  37.12 
 
 
350 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  32.95 
 
 
313 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.66 
 
 
313 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.05 
 
 
345 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.09 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.46 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.75 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 
328 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
335 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.21 
 
 
405 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.01 
 
 
335 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.42 
 
 
320 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  31.98 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.62 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
324 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
329 aa  119  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  31.27 
 
 
342 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 
338 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 
361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.01 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  28.57 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  34.6 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  35.79 
 
 
406 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.14 
 
 
395 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
416 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.35 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.84 
 
 
412 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 
415 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
361 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
417 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 
389 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.18 
 
 
362 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.98 
 
 
362 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 
319 aa  108  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  29.16 
 
 
428 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.1 
 
 
388 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
414 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  29.05 
 
 
323 aa  106  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
454 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  29.51 
 
 
495 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
365 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 
417 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  28.17 
 
 
417 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  25.99 
 
 
657 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
398 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.87 
 
 
387 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 
358 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.92 
 
 
329 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
436 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
434 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  29.08 
 
 
344 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
354 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 
438 aa  100  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
371 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
460 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
460 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
415 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
337 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
399 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.87 
 
 
312 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 
671 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  33.7 
 
 
413 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.34 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 
362 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  25.26 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 
385 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 
652 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
446 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.81 
 
 
465 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  27.51 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>