More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1072 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  100 
 
 		 410 aa  829    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  81.46 
 
 		 392 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  43.08 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  44.76 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  44.3 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  42.6 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  40.67 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  42.19 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  42.86 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  40.26 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  40.31 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  41.82 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  39.27 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  39.49 
 
 		 396 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  41.55 
 
 		 760 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2284  hypothetical protein  41.45 
 
 		 395 aa  260  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  38.34 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  36.79 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  38.42 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  39.11 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  38.14 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44235  predicted protein  32.53 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  35.88 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  35.13 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  32.46 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  36.45 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  31.93 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  35.17 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  34.24 
 
 		 613 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  33.94 
 
 		 420 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  33.68 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  29.04 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  32.45 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  33.42 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  34.48 
 
 		 436 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  32.11 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  32.45 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  32.53 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  34.51 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  35.4 
 
 		 414 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  31.13 
 
 		 422 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  34.28 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  31.88 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  33.42 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  34.67 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  29.12 
 
 		 447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  33.25 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  32.91 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  32.83 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  31.9 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  33.03 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  31.11 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  32.26 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  31.17 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  30.93 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  36.51 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  31.69 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  35.2 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  33.07 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  32.37 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.61 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  30.83 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  30.67 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  29.5 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  29.51 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  34.96 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  29.74 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  32.31 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  31.94 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  31.94 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  29.76 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  29.58 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  31.94 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  30.85 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  28.09 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  29.62 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  31.14 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  31.71 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  30.83 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  30.35 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  32.69 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  30.77 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.65 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.64 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.64 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.76 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  29 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  29.14 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  31.25 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.56 
 
 		 431 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09049  transesterase (LovD), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00920)  29.7 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  33.2 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  28.17 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  30.43 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  31.25 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  31.11 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  29.25 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  27.88 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  33.85 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>