More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1005 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1572    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 
848 aa  174  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.71 
 
 
851 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.71 
 
 
850 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
849 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.69 
 
 
847 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.48 
 
 
843 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  30.22 
 
 
845 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 
849 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
873 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
834 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.74 
 
 
861 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 
853 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 
855 aa  114  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.93 
 
 
850 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
845 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 
838 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.02 
 
 
858 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 
852 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 
856 aa  109  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  28.19 
 
 
849 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.36 
 
 
870 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.14 
 
 
866 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.75 
 
 
849 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.48 
 
 
854 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.33 
 
 
821 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.51 
 
 
854 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  29 
 
 
825 aa  99  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 
873 aa  97.4  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.57 
 
 
842 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 
855 aa  95.5  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.57 
 
 
859 aa  94.7  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  29.8 
 
 
842 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.28 
 
 
880 aa  94  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
842 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
842 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
871 aa  92.8  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
842 aa  92  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 
855 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.09 
 
 
841 aa  89.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.79 
 
 
836 aa  88.6  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3649  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 
839 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  26 
 
 
897 aa  86.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.51 
 
 
846 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.85 
 
 
878 aa  85.1  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
853 aa  84.7  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  32.13 
 
 
855 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 
844 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5621  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
843 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.458246  normal  0.150773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
877 aa  77.8  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 
866 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 
859 aa  77  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.17 
 
 
858 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.32 
 
 
849 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.73 
 
 
930 aa  75.5  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.75 
 
 
863 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  28.09 
 
 
651 aa  75.1  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  28.7 
 
 
877 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.23 
 
 
835 aa  75.1  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 
806 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.59 
 
 
852 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.67 
 
 
855 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.92 
 
 
855 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.98 
 
 
861 aa  71.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 
839 aa  71.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  25.92 
 
 
853 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.36 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  30.94 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
855 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.7 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  27.8 
 
 
841 aa  67.8  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  35.54 
 
 
381 aa  67.4  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.5 
 
 
397 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  33.6 
 
 
393 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.56 
 
 
399 aa  66.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0747  lipoprotein releasing system  26.79 
 
 
428 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  31.45 
 
 
408 aa  65.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.23 
 
 
411 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
462 aa  65.1  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 
397 aa  65.1  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 
822 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.74 
 
 
414 aa  64.7  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.59 
 
 
397 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  31.15 
 
 
408 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.09 
 
 
393 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.64 
 
 
389 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 
386 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  31.15 
 
 
400 aa  63.5  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.32 
 
 
390 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.74 
 
 
414 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  50 
 
 
843 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.07 
 
 
397 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3611  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 
836 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  27.25 
 
 
652 aa  62.4  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  28.35 
 
 
404 aa  62.4  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
376 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.16 
 
 
439 aa  62.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  43.02 
 
 
407 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.37 
 
 
856 aa  62  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 
430 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>