More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0937 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
345 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  81.1 
 
 
361 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  73.33 
 
 
354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  73.33 
 
 
354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  72.75 
 
 
354 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  68.41 
 
 
362 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  61.67 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  53.8 
 
 
372 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  50.15 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.92 
 
 
392 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  48.34 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  49.28 
 
 
386 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  46.95 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  46.06 
 
 
384 aa  223  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  47.5 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  43.15 
 
 
428 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  50.55 
 
 
396 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  47.59 
 
 
434 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  46.08 
 
 
333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  45.65 
 
 
385 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  53.39 
 
 
394 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  46.27 
 
 
391 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  45.82 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 
366 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 
444 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  51.5 
 
 
392 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  45.48 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.65 
 
 
492 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  47.81 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 
430 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.55 
 
 
486 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.54 
 
 
513 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.94 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.21 
 
 
481 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.21 
 
 
482 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.63 
 
 
481 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.63 
 
 
482 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.33 
 
 
482 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.11 
 
 
481 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.63 
 
 
482 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.04 
 
 
481 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.04 
 
 
482 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.07 
 
 
500 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 
502 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.04 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.53 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.39 
 
 
498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 
490 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
527 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
507 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
512 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
526 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  32.33 
 
 
519 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
588 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
520 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.7 
 
 
526 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.48 
 
 
435 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
495 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 
527 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.98 
 
 
528 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
523 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.83 
 
 
478 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 
503 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
522 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.35 
 
 
518 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.83 
 
 
473 aa  142  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  32.05 
 
 
519 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  34.01 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  32.7 
 
 
504 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.24 
 
 
530 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 
521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.78 
 
 
453 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 
516 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.92 
 
 
519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 
562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 
562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  31.34 
 
 
506 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.1 
 
 
565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.1 
 
 
565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 
502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 
565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.43 
 
 
502 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
506 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
561 aa  139  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 
527 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
594 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.97 
 
 
562 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1000  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
573 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00216584  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  34.45 
 
 
530 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  32.86 
 
 
503 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 
509 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  31.64 
 
 
504 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.4 
 
 
565 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.38 
 
 
562 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>