More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0929 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  54.93 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  58.18 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  53.03 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
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NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.21 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  42.67 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  55.36 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.12 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  53.57 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
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NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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