More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0819 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  72.45 
 
 
200 aa  286  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  52.22 
 
 
197 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  41.15 
 
 
198 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  44.44 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  44.44 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  44.44 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  44.44 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  43.96 
 
 
193 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  43.96 
 
 
193 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  43.96 
 
 
193 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  43.89 
 
 
209 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  43.89 
 
 
209 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  42.16 
 
 
194 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  41.24 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  44.26 
 
 
193 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.17 
 
 
201 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  37.93 
 
 
174 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.92 
 
 
204 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  37.11 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  37.37 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  41.9 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  38.33 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  36.87 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.45 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  39.46 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  35.05 
 
 
224 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  38.86 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 
226 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.13 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  36.22 
 
 
198 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  34.48 
 
 
235 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  37.43 
 
 
184 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
234 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  34.53 
 
 
215 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 
225 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  35.68 
 
 
199 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  33.99 
 
 
234 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  33.99 
 
 
234 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  33.8 
 
 
209 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  30.56 
 
 
243 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  34.24 
 
 
209 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 
209 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 
209 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 
209 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  32.46 
 
 
208 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  31.03 
 
 
212 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  30.57 
 
 
199 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  31.53 
 
 
259 aa  98.6  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  35.26 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  29.59 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  29.52 
 
 
262 aa  95.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  30.89 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  37.16 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  37.65 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  35.12 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  35.87 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  28.27 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  36.18 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  35.8 
 
 
202 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
187 aa  88.6  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.46 
 
 
208 aa  84.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  30.32 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  30.93 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  30.28 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  31.79 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.71 
 
 
819 aa  82  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  35.43 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.56 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  26.07 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  27.55 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  30.58 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  32.76 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  32.76 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  28.36 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.67 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  29.95 
 
 
879 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.07 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  29.95 
 
 
879 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  31.32 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  28.22 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  27.8 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  28.3 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  34.29 
 
 
827 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  29.47 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  29.08 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  33.14 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>