132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0735 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
235 aa  463  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0172  superoxide dismutase, copper/zinc binding  82.13 
 
 
236 aa  362  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.509734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0572  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  68.86 
 
 
228 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0584  superoxide dismutase, copper/zinc binding  68.86 
 
 
228 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0562  superoxide dismutase, copper/zinc binding  68.86 
 
 
228 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10437  periplasmic superoxide dismutase [Cu-Zn] sodC  63.25 
 
 
240 aa  275  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0336347  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  44.08 
 
 
244 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  41.03 
 
 
218 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4195  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  47.31 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4261  superoxide dismutase, copper/zinc binding  47.31 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.871501  normal  0.596639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4422  superoxide dismutase, copper/zinc binding  47.31 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.342214  normal  0.255666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1989  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.93 
 
 
268 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  44.31 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  42.86 
 
 
204 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  45.03 
 
 
220 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  43.6 
 
 
210 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.37 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.51 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  36.57 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  35.03 
 
 
178 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.69 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.1 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.09 
 
 
169 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.52 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  31.76 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.98 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.84 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.56 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  32.35 
 
 
172 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  34.55 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.73 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  31.75 
 
 
169 aa  62  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  32.64 
 
 
510 aa  62  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.89 
 
 
191 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.51 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.4 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.3 
 
 
172 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.52 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.9 
 
 
201 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.9 
 
 
201 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.9 
 
 
201 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.9 
 
 
180 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  35.03 
 
 
184 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.28 
 
 
181 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.17 
 
 
180 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.46 
 
 
179 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  30.6 
 
 
172 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  29.92 
 
 
158 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.9 
 
 
171 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.96 
 
 
183 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.95 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  29.55 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.73 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 
173 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.98 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  32.72 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.17 
 
 
179 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.88 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.98 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.98 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.98 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.98 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.98 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.71 
 
 
175 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.34 
 
 
179 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30 
 
 
171 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.2 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.54 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.99 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  34.75 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  30.06 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.28 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.57 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.29 
 
 
175 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.78 
 
 
170 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  29.78 
 
 
170 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.25 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  31.11 
 
 
172 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.78 
 
 
170 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.62 
 
 
190 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  28.42 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  31.28 
 
 
170 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  30.17 
 
 
171 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.73 
 
 
179 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  29.61 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.08 
 
 
185 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.17 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  30.08 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  28.96 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  29.32 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  29.19 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.29 
 
 
174 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.65 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.48 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  30.11 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  30.11 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  30.11 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  29.73 
 
 
173 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  29.89 
 
 
173 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  29.73 
 
 
173 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>