More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0732 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  92.39 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  85.28 
 
 		 197 aa  347  9e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  83.25 
 
 		 197 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  83.25 
 
 		 197 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  83.25 
 
 		 197 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  70.71 
 
 		 200 aa  267  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  67.51 
 
 		 198 aa  265  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  63.96 
 
 		 190 aa  260  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  64.1 
 
 		 195 aa  251  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  65.43 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  54.31 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  54.82 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  54.75 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  49.02 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  44.16 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  48.04 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  53.61 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  52.44 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46.99 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  45.25 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  46.45 
 
 		 168 aa  141  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  48.59 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  48 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  47.92 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  50.29 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  45.51 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  45.2 
 
 		 162 aa  134  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  50.62 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  51.53 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  45.51 
 
 		 162 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  44.69 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  50.85 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  41.84 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  50.61 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  48 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  47.75 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  44.63 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  45.41 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.89 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.19 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  44.5 
 
 		 182 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  42.37 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  39 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  45.68 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  40.68 
 
 		 162 aa  125  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  44.13 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  39.6 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  49.07 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  43.26 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  42.37 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.28 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  42.22 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  42.31 
 
 		 230 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  42.46 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  37.99 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  40.88 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  37.7 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  42.46 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  44.85 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  48.85 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  39.11 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  42.46 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.89 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.78 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  36.81 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.12 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  42.21 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.89 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  42.94 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.51 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.55 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  37.57 
 
 		 168 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.1 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  37.57 
 
 		 168 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.33 
 
 		 168 aa  98.2  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  38.04 
 
 		 169 aa  98.2  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  39.51 
 
 		 171 aa  98.2  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  38.51 
 
 		 150 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.89 
 
 		 170 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.89 
 
 		 170 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  36.65 
 
 		 147 aa  97.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  36.97 
 
 		 163 aa  97.8  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  37.08 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  40.24 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  39.02 
 
 		 167 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  37.08 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.78 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  38.76 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.67 
 
 		 164 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  37.43 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  38.04 
 
 		 152 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  41.1 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  38.89 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  38.65 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.89 
 
 		 164 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.33 
 
 		 168 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  38.67 
 
 		 216 aa  95.5  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.33 
 
 		 168 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  37.43 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>