More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0573 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  100 
 
 
597 aa  1206    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  62.46 
 
 
338 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  42.96 
 
 
607 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  35.91 
 
 
379 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  35.91 
 
 
379 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  35.91 
 
 
379 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  35.91 
 
 
379 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  35.91 
 
 
379 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  36.6 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  36.6 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  34.27 
 
 
377 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  34.27 
 
 
377 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  34.27 
 
 
369 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  34.27 
 
 
377 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  34.27 
 
 
377 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  33.92 
 
 
369 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  34.87 
 
 
400 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  34.04 
 
 
377 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  31.58 
 
 
383 aa  157  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  31.58 
 
 
383 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
383 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0460  hypothetical protein  37.12 
 
 
293 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  34.22 
 
 
391 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  34.22 
 
 
391 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  31.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  34.22 
 
 
391 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  33.22 
 
 
380 aa  143  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  31.54 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  31.54 
 
 
389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  31.54 
 
 
389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  31.54 
 
 
389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  34.59 
 
 
385 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  34.21 
 
 
385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  31.37 
 
 
399 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  30.49 
 
 
407 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  33.86 
 
 
425 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  30.03 
 
 
402 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  30.03 
 
 
402 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  30.03 
 
 
402 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  30.03 
 
 
402 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  33.89 
 
 
387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  33.89 
 
 
387 aa  120  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
382 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
382 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
382 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  30.42 
 
 
392 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  30.09 
 
 
335 aa  108  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 
391 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  31.27 
 
 
330 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  28.33 
 
 
395 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  28.33 
 
 
395 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  28.33 
 
 
395 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  28.33 
 
 
395 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  28.33 
 
 
395 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  28.33 
 
 
395 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
426 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
426 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
426 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
426 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
426 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  33.09 
 
 
434 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  33.09 
 
 
434 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
347 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
330 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
330 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
330 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  29.25 
 
 
335 aa  105  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  29.25 
 
 
320 aa  104  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
314 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
314 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
314 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
314 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
314 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  28.93 
 
 
335 aa  103  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  30.72 
 
 
307 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  30.95 
 
 
426 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  26.61 
 
 
276 aa  99.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  29.86 
 
 
373 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  29.86 
 
 
373 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  29.41 
 
 
431 aa  97.4  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 
315 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 
315 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 
315 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 
315 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>