103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0513 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  100 
 
 		 741 aa  1510    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  100 
 
 		 741 aa  1510    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  78.46 
 
 		 739 aa  1130    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  100 
 
 		 741 aa  1510    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  32.54 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  32.54 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  32.54 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  32.54 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  32.54 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  32.54 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  32.54 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 724 aa  300  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 724 aa  300  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 724 aa  300  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 724 aa  300  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  28.86 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  33.2 
 
 		 630 aa  124  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  33.2 
 
 		 630 aa  124  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  33.2 
 
 		 630 aa  124  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  33.2 
 
 		 630 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  33.2 
 
 		 630 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  33.2 
 
 		 630 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  33.2 
 
 		 630 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  36.96 
 
 		 637 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  33.04 
 
 		 721 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 721 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 737 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 663 aa  99  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  28.75 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  29.17 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  26.05 
 
 		 675 aa  75.5  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  30.29 
 
 		 701 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  27.95 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  33.61 
 
 		 708 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  25.72 
 
 		 710 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 710 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 710 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  23.96 
 
 		 461 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 367 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  28.25 
 
 		 608 aa  54.7  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  28.25 
 
 		 608 aa  54.7  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  28.36 
 
 		 608 aa  54.7  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  32.05 
 
 		 323 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 797 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 797 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 797 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 322 aa  50.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  26.09 
 
 		 328 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.68 
 
 		 398 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  30.95 
 
 		 617 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  30.95 
 
 		 617 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  32.67 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  27.91 
 
 		 744 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  27.72 
 
 		 310 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  42.11 
 
 		 356 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 326 aa  48.1  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  36.11 
 
 		 218 aa  48.1  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  25.59 
 
 		 827 aa  48.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 647 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 647 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 647 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  54.05 
 
 		 322 aa  47.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  39.47 
 
 		 618 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 381 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  38.36 
 
 		 297 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  28.82 
 
 		 312 aa  47  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  28.82 
 
 		 395 aa  47  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  35.9 
 
 		 356 aa  46.6  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  23.22 
 
 		 310 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  66.67 
 
 		 403 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  56.76 
 
 		 321 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 360 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  55.26 
 
 		 324 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 331 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  27.89 
 
 		 201 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  46.81 
 
 		 285 aa  45.8  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1183  phage integrase family protein  43.14 
 
 		 182 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  56.76 
 
 		 324 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  56.76 
 
 		 340 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1451  phage integrase family protein  43.14 
 
 		 182 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0649583 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  56.76 
 
 		 324 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  52.63 
 
 		 323 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  56.76 
 
 		 340 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  30.36 
 
 		 412 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  37 
 
 		 333 aa  45.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  48.08 
 
 		 463 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 806 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 328 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  54.05 
 
 		 182 aa  45.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0457  integrase family protein  54.05 
 
 		 182 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  54.05 
 
 		 322 aa  44.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  23.61 
 
 		 331 aa  44.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  23.61 
 
 		 331 aa  44.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  27.91 
 
 		 361 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  33.59 
 
 		 344 aa  44.3  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  39.39 
 
 		 322 aa  44.3  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  30.21 
 
 		 359 aa  44.3  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  40.85 
 
 		 319 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>