More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0496 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  63.53 
 
 
177 aa  214  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  56.57 
 
 
303 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  56.57 
 
 
303 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  56.57 
 
 
303 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  52.27 
 
 
294 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  49.42 
 
 
304 aa  161  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  49.46 
 
 
287 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  50.91 
 
 
188 aa  147  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  54.55 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  62.5 
 
 
127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  47.5 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  57.14 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  66.02 
 
 
103 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  52 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  44.23 
 
 
365 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  47.33 
 
 
131 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  46.53 
 
 
145 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  47.52 
 
 
139 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  47.52 
 
 
139 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  46.81 
 
 
139 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  46.81 
 
 
139 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  46.81 
 
 
139 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  46.81 
 
 
139 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  46.81 
 
 
139 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  40.49 
 
 
171 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.96 
 
 
281 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  40.49 
 
 
171 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.36 
 
 
281 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  40.49 
 
 
171 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  54.05 
 
 
124 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.36 
 
 
281 aa  101  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  53.15 
 
 
124 aa  99  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  35.8 
 
 
260 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  38.75 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.36 
 
 
281 aa  94.4  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  38.04 
 
 
177 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  38.04 
 
 
177 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  38.04 
 
 
177 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  38.04 
 
 
177 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  38.04 
 
 
177 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  40.25 
 
 
151 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  40.25 
 
 
151 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  40.25 
 
 
151 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  35.67 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  35.67 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  35.67 
 
 
210 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  34.59 
 
 
149 aa  88.2  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  37.04 
 
 
260 aa  88.2  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  37.04 
 
 
260 aa  88.2  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  40.51 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  40.51 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  40.51 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  40.51 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  40.51 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  40.51 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.67 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  39.24 
 
 
254 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  39.24 
 
 
254 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  39.24 
 
 
254 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  39.24 
 
 
254 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  39.24 
 
 
254 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  37.89 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  37.89 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  39.01 
 
 
273 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  37.89 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  37.89 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  35.44 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  33.73 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  37.5 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  37.5 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4189  putative transposase  53.95 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4225  putative transposase  53.95 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  35.22 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  35.44 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  35.44 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  35.22 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  35.95 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  37.34 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  36.13 
 
 
255 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  39.38 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  37.23 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  39.38 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3079  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  34.78 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  32.91 
 
 
336 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  33.92 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  34.78 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  30.72 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  35.4 
 
 
260 aa  77.8  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  35.4 
 
 
260 aa  77.8  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  32.91 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  32.91 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  32.91 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  32.91 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  32.91 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  32.91 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>