59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0389 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  69.02 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  39.68 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  43.12 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  46.03 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  39.68 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.04 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  44.93 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  30.58 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 199 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 238 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  35.38 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>