More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0377 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  78.34 
 
 
494 aa  754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  75.05 
 
 
527 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  70.42 
 
 
495 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  72.91 
 
 
476 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  100 
 
 
490 aa  968    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  84.52 
 
 
491 aa  813    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  70.48 
 
 
498 aa  628  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  59.88 
 
 
486 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  57.52 
 
 
509 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  57.93 
 
 
575 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  58.69 
 
 
501 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  53.27 
 
 
529 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  58.47 
 
 
521 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  58.6 
 
 
501 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  55.85 
 
 
511 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  54.62 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  54.07 
 
 
509 aa  461  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  55.49 
 
 
509 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  52.99 
 
 
507 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  53.42 
 
 
520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  53.45 
 
 
508 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  49.41 
 
 
517 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  53.33 
 
 
495 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  53.33 
 
 
495 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  53.33 
 
 
495 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  51.81 
 
 
499 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  47.66 
 
 
485 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  45.38 
 
 
484 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  46.23 
 
 
488 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  46.3 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.77 
 
 
485 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  46.52 
 
 
483 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  47.31 
 
 
490 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  47.84 
 
 
481 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  46.75 
 
 
491 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  47.81 
 
 
485 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  47.64 
 
 
481 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  45.17 
 
 
484 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  45.34 
 
 
483 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  46.9 
 
 
490 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  45.17 
 
 
484 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  46.11 
 
 
506 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  45.17 
 
 
484 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.86 
 
 
475 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.33 
 
 
484 aa  359  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.19 
 
 
513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.99 
 
 
506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  41.96 
 
 
506 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  46.5 
 
 
483 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  42.18 
 
 
485 aa  355  8.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  41.96 
 
 
506 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.06 
 
 
772 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  41.7 
 
 
506 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.41 
 
 
500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  40.83 
 
 
514 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  37.04 
 
 
494 aa  352  8.999999999999999e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  38.11 
 
 
514 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  45.17 
 
 
495 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  48.05 
 
 
481 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40.78 
 
 
536 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  44.54 
 
 
480 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.52 
 
 
489 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.12 
 
 
776 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  40.94 
 
 
560 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.68 
 
 
495 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  45.96 
 
 
493 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  43 
 
 
863 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  42.77 
 
 
498 aa  346  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  45.31 
 
 
485 aa  345  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.45 
 
 
503 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  41.92 
 
 
797 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  43.71 
 
 
481 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.16 
 
 
491 aa  343  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  42.35 
 
 
534 aa  342  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  41.85 
 
 
508 aa  342  8e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  44.49 
 
 
518 aa  342  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  41.2 
 
 
491 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  41.14 
 
 
777 aa  342  9e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  41.04 
 
 
491 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  41.03 
 
 
565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  37.65 
 
 
501 aa  340  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  40.63 
 
 
556 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.57 
 
 
502 aa  340  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  40.68 
 
 
517 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  46.57 
 
 
489 aa  339  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  45.14 
 
 
496 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.86 
 
 
513 aa  339  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  43.45 
 
 
498 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  36.78 
 
 
507 aa  339  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.8 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  44.76 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  41.19 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.01 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.93 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  43.51 
 
 
484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  41.32 
 
 
495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  43.39 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  40.47 
 
 
526 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.43 
 
 
864 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  39.77 
 
 
787 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>