More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0170 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  33.94 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  38.55 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  33.95 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  30.39 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 419 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  51.06 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  51.06 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  51.06 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.91 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  51.06 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  51.06 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 87 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>