More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0161 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  100 
 
 
329 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  82.79 
 
 
320 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  80.46 
 
 
378 aa  511  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  80.46 
 
 
354 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  77.02 
 
 
315 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  80.06 
 
 
315 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  75.08 
 
 
327 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  77.39 
 
 
324 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  77.1 
 
 
338 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  69.61 
 
 
324 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  69.9 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  71.01 
 
 
313 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  71.01 
 
 
313 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  71.01 
 
 
313 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  66.77 
 
 
325 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  68.81 
 
 
321 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  64.94 
 
 
321 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  62.58 
 
 
319 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  62.58 
 
 
319 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  62.58 
 
 
319 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  64.38 
 
 
317 aa  391  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  61.49 
 
 
326 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  61.49 
 
 
326 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  61.49 
 
 
326 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  60.78 
 
 
337 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  60.78 
 
 
321 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  59.62 
 
 
345 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  59.62 
 
 
343 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  59.62 
 
 
343 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  49.36 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  50.97 
 
 
313 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  50 
 
 
317 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  47.85 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  47.19 
 
 
354 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  47.19 
 
 
354 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  46.5 
 
 
329 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  46.2 
 
 
316 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  47.52 
 
 
318 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.86 
 
 
316 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  47.52 
 
 
318 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  48.57 
 
 
316 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  46.86 
 
 
329 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  46.86 
 
 
318 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  46.86 
 
 
342 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  45.98 
 
 
315 aa  288  9e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  46.2 
 
 
319 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  48.18 
 
 
317 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  46.53 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  46.2 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  47.85 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  44.34 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  50.32 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  45.93 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  47.74 
 
 
322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  47.64 
 
 
306 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  46.77 
 
 
318 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  45.87 
 
 
316 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  44.55 
 
 
320 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  44.55 
 
 
320 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  44.55 
 
 
320 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  44.16 
 
 
315 aa  279  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.44 
 
 
310 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  44.55 
 
 
316 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  45.72 
 
 
322 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  44.12 
 
 
319 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  43.89 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  43.79 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  43.79 
 
 
319 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  45.45 
 
 
322 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  47.21 
 
 
310 aa  267  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  41.77 
 
 
324 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  43.61 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  43.71 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  39.48 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  45.71 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  43.45 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  45.02 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  43.73 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  42.62 
 
 
318 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  43.41 
 
 
318 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  43.35 
 
 
345 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  43.04 
 
 
320 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  42.72 
 
 
320 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  44.48 
 
 
333 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  45.66 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  41.93 
 
 
412 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  44.16 
 
 
316 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  40.85 
 
 
321 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  42.62 
 
 
321 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  42.28 
 
 
321 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  42.62 
 
 
319 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33400  agmatinase  42.72 
 
 
343 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.294688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  40.67 
 
 
320 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  42.72 
 
 
322 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  44.01 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>