More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0107 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0107  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
322 aa  628  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  89.06 
 
 
320 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  72.9 
 
 
321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.27 
 
 
321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  72.27 
 
 
321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10150  quinone oxidoreductase  63.35 
 
 
322 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  52.65 
 
 
322 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.5 
 
 
322 aa  255  8e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  46.89 
 
 
324 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 
324 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  47.38 
 
 
323 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.98 
 
 
323 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.34 
 
 
331 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
333 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
333 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1523  alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
333 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0659671  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.44 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
325 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  43.92 
 
 
325 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
325 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  43.58 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.11 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.49 
 
 
325 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
326 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  41.61 
 
 
325 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.46 
 
 
328 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
324 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1858  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
324 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0130  alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 
320 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
323 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  41.67 
 
 
324 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
324 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
324 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.81 
 
 
324 aa  188  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.4 
 
 
335 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
324 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.31 
 
 
324 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
361 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 
324 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
333 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.43 
 
 
324 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.43 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0870  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.61 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 
324 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  40.74 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.24 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.43 
 
 
324 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.62 
 
 
329 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  40.27 
 
 
331 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
324 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
319 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
324 aa  178  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
334 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 
326 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
331 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
326 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41 
 
 
329 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.14 
 
 
326 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
328 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
337 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  41.16 
 
 
325 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  43.1 
 
 
329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.36 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.63 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.04 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.8 
 
 
325 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.22 
 
 
327 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.62 
 
 
327 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
325 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 
331 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  39.32 
 
 
324 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 
324 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
340 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
324 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
326 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.31 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
326 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 
326 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
324 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
324 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  41.06 
 
 
326 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 
326 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.6 
 
 
326 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  39.51 
 
 
325 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.81 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>