148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0102 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  71.28 
 
 		 188 aa  280  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  39.41 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  33.54 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  33.54 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  33.54 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  26.45 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  29.37 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  23.53 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  35.79 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  24.2 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  26.62 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 310 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  26.9 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  31.67 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 424 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  30.36 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  31.43 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>