41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0057 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  58.25 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  55.61 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  50.26 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  43.62 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  42.93 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  39.36 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  40 
 
 		 224 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  39.06 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  38.38 
 
 		 230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  39.78 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  37.89 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  37.08 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  37.3 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  39.59 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  35.92 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  35.92 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  35.92 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  35.05 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  37.36 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  45.24 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  35.33 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  34.95 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  37.63 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  34.46 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  32.56 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  34.55 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  35.53 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  34.21 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  34.87 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  35.26 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  35.26 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  29.94 
 
 		 183 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  28.11 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  25.95 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  30.65 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  28.32 
 
 		 261 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>