42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0049 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  100 
 
 
627 aa  1264    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  54.83 
 
 
615 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  54.83 
 
 
615 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  54.68 
 
 
615 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  46.92 
 
 
656 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  32.8 
 
 
654 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  29.6 
 
 
619 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  28.73 
 
 
516 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  28.95 
 
 
525 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  31.69 
 
 
590 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  32.56 
 
 
609 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  32.48 
 
 
554 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  28.15 
 
 
594 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  26.7 
 
 
556 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  26.33 
 
 
554 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  27.79 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.12 
 
 
533 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  30.46 
 
 
507 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  28.48 
 
 
501 aa  123  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.92 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  28.71 
 
 
368 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  28.57 
 
 
569 aa  107  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  30.67 
 
 
557 aa  107  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  29.68 
 
 
469 aa  101  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  34.35 
 
 
393 aa  90.5  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  26.42 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.66 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0088  hypothetical protein  27.27 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.210436  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  32.95 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  30.74 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  29.07 
 
 
507 aa  73.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  33.33 
 
 
547 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  27.55 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  24 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  28.25 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  25.35 
 
 
564 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0996  hypothetical protein  31.01 
 
 
160 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  32.35 
 
 
234 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  25.76 
 
 
538 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  38.46 
 
 
339 aa  50.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  23.56 
 
 
403 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  45 
 
 
441 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>