More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0043 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 483 aa  924    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  84.62 
 
 		 487 aa  725    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  83.58 
 
 		 483 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  83.58 
 
 		 483 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  90.48 
 
 		 483 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  58.2 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  55.12 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  55.12 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  55.12 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  35.46 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  34.22 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  32.99 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  33.7 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  35.12 
 
 		 496 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  31.49 
 
 		 547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  30.61 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  31.93 
 
 		 513 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 538 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 562 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 510 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  27.76 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  27.77 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  27.05 
 
 		 527 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 522 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 521 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.17 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 441 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 527 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  24.9 
 
 		 571 aa  90.5  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  26.53 
 
 		 523 aa  90.5  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  25.57 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 515 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.25 
 
 		 468 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 466 aa  87  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 528 aa  86.7  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  26.79 
 
 		 496 aa  86.7  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  28.37 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.1 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  28.37 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.1 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.76 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.9 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.9 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.9 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  23.35 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.98 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  23.09 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.9 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.9 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.86 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  24.01 
 
 		 576 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.26 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.15 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  25.45 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  22.83 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  28.8 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.36 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.86 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  27.17 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  27.17 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  27.17 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  22.83 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  22.83 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  22.83 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  22.83 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  27.17 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  27.17 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  22.83 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>