57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0041 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  983    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  40.48 
 
 
542 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  40.48 
 
 
542 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  40.48 
 
 
542 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  51.12 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  37.25 
 
 
528 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  32.16 
 
 
580 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  38.46 
 
 
307 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  38.46 
 
 
307 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  38.46 
 
 
307 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  28.49 
 
 
526 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  30.7 
 
 
517 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  30.7 
 
 
517 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  30.42 
 
 
517 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  29.25 
 
 
655 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.3 
 
 
499 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  31.61 
 
 
540 aa  90.9  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  33.06 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  30.1 
 
 
533 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  34.66 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  28.99 
 
 
502 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  28.63 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  29.66 
 
 
533 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  33.17 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  31.22 
 
 
527 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  34.2 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  32.91 
 
 
529 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  32.91 
 
 
529 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  30.88 
 
 
588 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  31.39 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  31.39 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  27.68 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  30.85 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  32.02 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  30.13 
 
 
433 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  30.13 
 
 
413 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  30.13 
 
 
433 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  27.68 
 
 
377 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  27.68 
 
 
377 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  31.03 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  27.68 
 
 
377 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  29.62 
 
 
783 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  26.22 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  26.32 
 
 
380 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  28.57 
 
 
359 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  27.49 
 
 
401 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  29.76 
 
 
421 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  26.54 
 
 
518 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  30.05 
 
 
768 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  33.53 
 
 
416 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  29.9 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  28.2 
 
 
461 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  25.79 
 
 
435 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  25.52 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  30.66 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  30.4 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>