More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0013 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0013  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.798633  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4651  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  91.94 
 
 
368 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5034  alcohol dehydrogenase  91.94 
 
 
368 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952977  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4739  alcohol dehydrogenase  91.94 
 
 
368 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  69.89 
 
 
368 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3182  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.86 
 
 
368 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3194  alcohol dehydrogenase  65.86 
 
 
368 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3244  alcohol dehydrogenase  65.86 
 
 
368 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4959  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.58 
 
 
383 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4775  alcohol dehydrogenase  53.78 
 
 
370 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142879  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5074  alcohol dehydrogenase  53.78 
 
 
370 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5270  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 
370 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4689  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.78 
 
 
370 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5164  alcohol dehydrogenase  50.27 
 
 
376 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1486  alcohol dehydrogenase  52.97 
 
 
370 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1593  alcohol dehydrogenase  50.27 
 
 
376 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10776  zinc-type alcohol dehydrogenase NAD dependent adhB  49.73 
 
 
375 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13103  zinc-type alcohol dehydrogenase adhD (aldehyde reductase)  53.78 
 
 
368 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.256708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.59 
 
 
372 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3153  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.87 
 
 
375 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4968  alcohol dehydrogenase  50.8 
 
 
375 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4585  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.8 
 
 
375 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4673  alcohol dehydrogenase  50.8 
 
 
375 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3128  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.2 
 
 
376 aa  357  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4948  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.73 
 
 
375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0127  alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0137  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0146  alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625258  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4041  alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 
377 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4492  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.87 
 
 
375 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.67 
 
 
368 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.97 
 
 
370 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3840  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.75 
 
 
385 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.02 
 
 
375 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.58 
 
 
359 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.58 
 
 
375 aa  235  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2495  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 
369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.58 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 
372 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
375 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  36.98 
 
 
368 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
368 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5970  alcohol dehydrogenase class III  36.65 
 
 
369 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.66491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3129  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
368 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0277629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2166  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
369 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
362 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3418  alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
369 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128659  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2034  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
369 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
368 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
368 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.75 
 
 
379 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
379 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
379 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
379 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
379 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.34 
 
 
368 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1839  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1703  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  36.6 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0144  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.41 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  36.36 
 
 
376 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
369 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0101  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
369 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.618314  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
368 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4957  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3946  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.81 
 
 
375 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136924  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  36.65 
 
 
368 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0483  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
368 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27799  hitchhiker  0.00130269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.07 
 
 
368 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  36.22 
 
 
379 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0713  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase(FlhA)  35.62 
 
 
368 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.009216  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  36.6 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.22 
 
 
369 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3253  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
368 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4639  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
369 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
376 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.41 
 
 
372 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.7 
 
 
370 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  37 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0473  alcohol dehydrogenase class III/S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.14 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1024  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.55 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0243733  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4830  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.544706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0536  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.67 
 
 
371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262053  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 
376 aa  215  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
374 aa  215  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0803  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0246485  normal  0.0104055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.96 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3587  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2527  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0605767  normal  0.410127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.75 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>