147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1723 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  4.43469e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  55.26 
 
 
153 aa  167  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  54.3 
 
 
153 aa  165  3e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  55.19 
 
 
151 aa  164  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  53.64 
 
 
154 aa  162  2e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  8.96212e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  52.32 
 
 
153 aa  158  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  50.33 
 
 
153 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  8.69512e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  50.33 
 
 
153 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  50.33 
 
 
153 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  8.66939e-06  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  50.98 
 
 
154 aa  150  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  49.02 
 
 
151 aa  150  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.8702e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  49.67 
 
 
156 aa  145  2e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  49.04 
 
 
157 aa  139  1e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  45.7 
 
 
156 aa  132  1e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  42.28 
 
 
153 aa  126  1e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  43.14 
 
 
152 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  43.84 
 
 
157 aa  117  5e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  45.21 
 
 
151 aa  113  8e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  42.07 
 
 
168 aa  112  2e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  39.33 
 
 
185 aa  109  1e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  39.1 
 
 
156 aa  108  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  7.29368e-10  unclonable  4.29528e-07 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  40.44 
 
 
165 aa  107  4e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  40.69 
 
 
185 aa  107  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  38.24 
 
 
159 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  35.37 
 
 
185 aa  101  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  38.93 
 
 
154 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  38.36 
 
 
198 aa  100  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.25 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  42.97 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  36.36 
 
 
184 aa  78.2  4e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  33.33 
 
 
186 aa  76.3  1e-13  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  32.68 
 
 
185 aa  76.6  1e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  33.8 
 
 
182 aa  70.9  7e-12  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  31.75 
 
 
146 aa  60.5  8e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  45.71 
 
 
121 aa  59.3  2e-08  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  9.22526e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  30.66 
 
 
113 aa  55.8  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  30.66 
 
 
114 aa  55.1  3e-07  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  29.93 
 
 
114 aa  55.1  3e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  27.74 
 
 
112 aa  52.4  2e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  28.93 
 
 
116 aa  52  3e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  30.95 
 
 
212 aa  52  3e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  30.23 
 
 
110 aa  50.8  6e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43227e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  30.66 
 
 
115 aa  50.1  1e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  29.29 
 
 
114 aa  49.3  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  30.5 
 
 
116 aa  48.9  2e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  35.71 
 
 
110 aa  48.9  3e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  48.9  3e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.05775e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
115 aa  48.9  3e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.48826e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  28.68 
 
 
110 aa  48.5  3e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  48.1  4e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  27.74 
 
 
113 aa  48.1  4e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 
125 aa  48.1  4e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  27.54 
 
 
113 aa  48.1  4e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 
110 aa  47.8  6e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.50597e-05  decreased coverage  4.66099e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 
119 aa  47.4  8e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  28.28 
 
 
118 aa  47  8e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 
110 aa  47  9e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.90323e-05  unclonable  1.56346e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 
110 aa  47  9e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.13672e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 
110 aa  47  9e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.84145e-06  unclonable  4.44445e-11 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  30.14 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  36.99 
 
 
111 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.86157e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  35.62 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.08091e-06  unclonable  5.72517e-12 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.76221e-05  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.70436e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.91248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.74538e-05  unclonable  1.70547e-11 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  35.82 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.3887e-09  hitchhiker  1.2298e-09 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.93561e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  27.91 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  28.99 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.33531e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  32.39 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.16767e-06  hitchhiker  1.3248e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.08825e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.7277e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  26.28 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.64158e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  26.81 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.07093e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.18335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.6654e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.071e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.02093e-10  unclonable  1.16173e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.08329e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.21136e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  30.99 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.02891e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  34.25 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  38.24 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  26.28 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  31.37 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.66371e-07  unclonable  7.08625e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.21106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  34.25 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.76786e-14 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>