219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1695 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 
335 aa  688    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  66.9 
 
 
290 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  57.88 
 
 
316 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  58.82 
 
 
316 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  57.44 
 
 
316 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.39 
 
 
255 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  38.24 
 
 
483 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  36.33 
 
 
486 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  37.13 
 
 
483 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  37.5 
 
 
490 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.42 
 
 
502 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.59 
 
 
492 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  38.75 
 
 
486 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  36.36 
 
 
499 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  37.87 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  36.97 
 
 
486 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.13 
 
 
502 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  35.42 
 
 
488 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.8 
 
 
499 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  34.72 
 
 
489 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.99 
 
 
483 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  40.41 
 
 
494 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  36.19 
 
 
495 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  34.63 
 
 
484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  34.63 
 
 
484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.3 
 
 
486 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  36.82 
 
 
526 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.82 
 
 
526 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  34.52 
 
 
518 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  34.52 
 
 
518 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  36.64 
 
 
529 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  33.33 
 
 
496 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  37.02 
 
 
515 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  36.59 
 
 
495 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  35.48 
 
 
495 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  34.54 
 
 
524 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  34.09 
 
 
528 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  28.44 
 
 
290 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  24.49 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  26.15 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.34 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.94 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  26.96 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  27.05 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25.58 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  27.15 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.33 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  23.64 
 
 
271 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.62 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  24.57 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.16 
 
 
282 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  25.5 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.72 
 
 
282 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  26.07 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  26.07 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  26.32 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.87 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  23.4 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  23.55 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.55 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.57 
 
 
282 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25.19 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  26.71 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  25.99 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.71 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.66 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  26.71 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  26.71 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  23.62 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.01 
 
 
283 aa  60.8  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  24.57 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  24.57 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  24.57 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  24.57 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  27.6 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  24.19 
 
 
262 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  24.57 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.67 
 
 
285 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  21.48 
 
 
324 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  23.21 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.32 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  23.13 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  23.13 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  23.95 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.55 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  23.55 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  23.55 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.97 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  23.55 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  23.55 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  23.89 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.89 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.89 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.89 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  23.62 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.93 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  23.21 
 
 
301 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.62 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  23.64 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  23.5 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>