167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1559 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 330 aa  681    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  65.76 
 
 		 331 aa  454  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.37 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  34.78 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.92 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.23 
 
 		 550 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  36 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  36.53 
 
 		 594 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  34.18 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  34.16 
 
 		 598 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.63 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  32.8 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  35.15 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  32.85 
 
 		 339 aa  175  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  32.8 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.14 
 
 		 580 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  33.63 
 
 		 727 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.32 
 
 		 570 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.02 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.09 
 
 		 545 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.83 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.75 
 
 		 544 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  31.38 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  32.15 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.34 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  32.46 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.86 
 
 		 731 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 731 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.47 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  34.31 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.83 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  32.74 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.33 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.41 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.75 
 
 		 559 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  30.97 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.81 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  31.56 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  32.84 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  29.67 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  33.13 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.63 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.27 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  33.14 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  32.25 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.88 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  31.76 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.73 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  32.12 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  31.27 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  31.21 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  30.99 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.95 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.65 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  28.66 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  32.26 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.87 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  31.31 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.66 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.87 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.19 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  29.84 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.36 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  30.92 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.92 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.38 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  29.14 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.55 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  26.86 
 
 		 331 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  31.06 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  28.39 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  27.83 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.61 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  29.88 
 
 		 525 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.38 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  25.89 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.95 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.03 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  31.67 
 
 		 691 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  27.1 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.76 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  30.75 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  26.86 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  35.86 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.04 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  25.75 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.1 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  23.93 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.76 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.04 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  28.48 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>