More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1484 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1061 aa  2080    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  28.34 
 
 		 1057 aa  290  8e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  41.92 
 
 		 812 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.46 
 
 		 789 aa  126  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  25.22 
 
 		 1019 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  21.96 
 
 		 993 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  22.8 
 
 		 1023 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  36.79 
 
 		 955 aa  104  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.94 
 
 		 924 aa  102  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.75 
 
 		 895 aa  100  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.73 
 
 		 864 aa  99.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  22.73 
 
 		 906 aa  94.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  23.39 
 
 		 1021 aa  93.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  23.37 
 
 		 993 aa  92.8  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  21.99 
 
 		 1031 aa  92.8  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.9 
 
 		 702 aa  90.1  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.1 
 
 		 993 aa  89  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.43 
 
 		 891 aa  85.1  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  27.11 
 
 		 857 aa  82.4  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  22.33 
 
 		 858 aa  82.4  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.27 
 
 		 891 aa  81.6  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  25.24 
 
 		 1022 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  30.47 
 
 		 890 aa  79  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  32.57 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.04 
 
 		 702 aa  79  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.04 
 
 		 902 aa  78.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.21 
 
 		 1108 aa  75.5  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 		 702 aa  74.3  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  29.3 
 
 		 1008 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  28.92 
 
 		 1016 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 1019 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.54 
 
 		 1074 aa  71.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  27.93 
 
 		 1223 aa  71.2  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  31.82 
 
 		 829 aa  71.6  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  32.29 
 
 		 840 aa  71.2  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  34.45 
 
 		 1203 aa  70.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  29.77 
 
 		 978 aa  70.1  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1186 aa  69.3  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  22.12 
 
 		 1059 aa  68.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.48 
 
 		 994 aa  68.9  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.81 
 
 		 1003 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  26.37 
 
 		 804 aa  67.4  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  33.87 
 
 		 1172 aa  67.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  33.88 
 
 		 1234 aa  66.6  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  36.54 
 
 		 1191 aa  66.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.6 
 
 		 1178 aa  66.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  34.62 
 
 		 1183 aa  65.5  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  27 
 
 		 1196 aa  65.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  33.88 
 
 		 1227 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  33.88 
 
 		 1218 aa  65.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  33.65 
 
 		 1222 aa  65.1  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1185 aa  65.1  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  33.65 
 
 		 1195 aa  64.7  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  32.77 
 
 		 1213 aa  64.7  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  23.6 
 
 		 1022 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.87 
 
 		 935 aa  64.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1222 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1217 aa  64.3  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1188 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 		 1189 aa  64.3  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  34.62 
 
 		 1188 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  23.45 
 
 		 1008 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  38.3 
 
 		 1080 aa  63.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1224 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 		 1192 aa  62.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1198 aa  62.4  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  23.27 
 
 		 1008 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1198 aa  62.4  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  33.65 
 
 		 1263 aa  62  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  30.87 
 
 		 950 aa  62  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 		 1171 aa  62  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  28.14 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1214 aa  61.6  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  21.33 
 
 		 1007 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  28.07 
 
 		 1007 aa  60.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  33.65 
 
 		 1188 aa  61.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  28.47 
 
 		 514 aa  60.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  31.09 
 
 		 1225 aa  60.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.58 
 
 		 859 aa  60.1  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1191 aa  59.7  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.66 
 
 		 851 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 		 1194 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  23.45 
 
 		 1164 aa  59.7  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  24.44 
 
 		 926 aa  59.7  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 852 aa  59.7  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 		 1194 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 852 aa  59.7  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 		 1175 aa  58.9  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  31.73 
 
 		 1217 aa  59.3  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 		 1170 aa  58.9  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  33.85 
 
 		 1148 aa  59.3  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 		 1187 aa  58.9  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 		 1170 aa  58.9  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 		 1188 aa  58.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1179 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  31.55 
 
 		 805 aa  58.5  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1181 aa  58.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.85 
 
 		 859 aa  58.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1184 aa  58.2  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  32.26 
 
 		 1195 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>