More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1474 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
162 aa  330  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  46.48 
 
 
244 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  43.08 
 
 
560 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  45.08 
 
 
1276 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  45.32 
 
 
927 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  47.54 
 
 
1694 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  43.1 
 
 
543 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  42.64 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
388 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
388 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  42.31 
 
 
573 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  42.97 
 
 
602 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
562 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  43.7 
 
 
523 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.52 
 
 
836 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.57 
 
 
397 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  43.36 
 
 
250 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  39.1 
 
 
344 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
361 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  41.18 
 
 
1007 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
699 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
452 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 
202 aa  98.2  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  40.34 
 
 
279 aa  97.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 
4079 aa  97.4  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.51 
 
 
707 aa  97.1  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  41.74 
 
 
715 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
366 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  37.88 
 
 
314 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
512 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.66 
 
 
784 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 
390 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.2 
 
 
730 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.59 
 
 
810 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 
465 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
360 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
243 aa  90.9  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
254 aa  90.9  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.67 
 
 
623 aa  90.9  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  37.19 
 
 
275 aa  90.5  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
1192 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
878 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  30.82 
 
 
240 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  40.18 
 
 
576 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 
3035 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  36.59 
 
 
1979 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
213 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
1121 aa  89  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
3560 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
523 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
1276 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.07 
 
 
706 aa  87.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 
716 aa  87  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.49 
 
 
745 aa  87  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  35.38 
 
 
1138 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  43.43 
 
 
713 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
357 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
761 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
732 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
4489 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 
632 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 
743 aa  85.1  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
414 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  34.07 
 
 
417 aa  84.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
409 aa  84.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.21 
 
 
988 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
306 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  40.19 
 
 
635 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
620 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  42.16 
 
 
574 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.09 
 
 
1022 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 
740 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
1069 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
711 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
617 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.65 
 
 
620 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
435 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.8 
 
 
626 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.66 
 
 
820 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
649 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
356 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  34.06 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
352 aa  81.6  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
1297 aa  81.3  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 
465 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
1049 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 
221 aa  80.9  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  34.27 
 
 
1240 aa  80.9  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
467 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  32.74 
 
 
564 aa  80.5  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  40.21 
 
 
191 aa  80.5  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 
270 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.43 
 
 
626 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
614 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>