217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1374 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  67.09 
 
 
500 aa  683    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  971    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  63.31 
 
 
486 aa  633  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  60.13 
 
 
477 aa  578  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  56.72 
 
 
480 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  56.09 
 
 
480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  55.67 
 
 
480 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  59.92 
 
 
478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  62.08 
 
 
477 aa  558  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  55.95 
 
 
484 aa  548  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  52.94 
 
 
480 aa  547  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  59.7 
 
 
477 aa  544  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  55.53 
 
 
486 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  52.84 
 
 
482 aa  535  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  54.6 
 
 
482 aa  531  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  59.23 
 
 
477 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  53.44 
 
 
484 aa  529  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  55.53 
 
 
486 aa  522  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  51.77 
 
 
498 aa  520  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  54.2 
 
 
486 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  52.4 
 
 
484 aa  521  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  54.49 
 
 
486 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  52.4 
 
 
484 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  52.71 
 
 
484 aa  498  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  53.04 
 
 
477 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  52 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  51.98 
 
 
486 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  52 
 
 
474 aa  490  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  50 
 
 
493 aa  480  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  52.53 
 
 
476 aa  472  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  50.1 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  50.95 
 
 
477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  49.9 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  48.96 
 
 
485 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  51.72 
 
 
477 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  49.58 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  48.75 
 
 
485 aa  461  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  50.94 
 
 
480 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  50.21 
 
 
481 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  51.05 
 
 
476 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  48.75 
 
 
485 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  47.19 
 
 
482 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  48.59 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  48.41 
 
 
472 aa  460  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  49.79 
 
 
476 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  48.44 
 
 
486 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  48.23 
 
 
486 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  49.58 
 
 
476 aa  455  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  50.65 
 
 
476 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  48.89 
 
 
502 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  48.65 
 
 
488 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  49.06 
 
 
487 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  47.78 
 
 
477 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  49.06 
 
 
487 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  51.56 
 
 
963 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  50.97 
 
 
476 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  49.48 
 
 
486 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  47.81 
 
 
475 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.41 
 
 
514 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  49.65 
 
 
443 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  49.16 
 
 
476 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  48.63 
 
 
476 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  51.27 
 
 
475 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  49.59 
 
 
479 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  51.46 
 
 
484 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  53.05 
 
 
472 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  51.58 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  53 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  53.47 
 
 
988 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  52.32 
 
 
465 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  50.74 
 
 
475 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  47.51 
 
 
473 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  43.92 
 
 
478 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  46.09 
 
 
473 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  42.54 
 
 
447 aa  332  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  37.95 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  33.26 
 
 
451 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.13 
 
 
514 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  31.08 
 
 
384 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  33.03 
 
 
395 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.97 
 
 
396 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  30.71 
 
 
511 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  31.08 
 
 
388 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  33.33 
 
 
472 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  32.78 
 
 
394 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  33.26 
 
 
407 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  33.49 
 
 
395 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  30.79 
 
 
389 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 
402 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  31.4 
 
 
397 aa  156  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.26 
 
 
398 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.41 
 
 
384 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  31.07 
 
 
395 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  31.05 
 
 
393 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  31.15 
 
 
463 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  31.37 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  29.4 
 
 
398 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  30.18 
 
 
388 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  29.01 
 
 
393 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  31.98 
 
 
470 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>