64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1352 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  55.26 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  53.1 
 
 		 226 aa  248  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  52.65 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  50.22 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  45.02 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  39.47 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  40.17 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  39.91 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  40.61 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  38.22 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  40.27 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  38.7 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  36.44 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  37.12 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  39.66 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  38.81 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  38.22 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  38.46 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  37.27 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  38.81 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  38.58 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  39.66 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  36.05 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  39.06 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  38.56 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  36.36 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  34.36 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  31.82 
 
 		 652 aa  102  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  31.84 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  31.37 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  33.94 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  32.81 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  28.1 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  28.1 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  29.9 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  27.14 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  30.94 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  28.5 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  26.73 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  26.44 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  28.71 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  28.14 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  27.36 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  27.36 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  27.75 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  28.71 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  26.47 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  29.36 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  32.19 
 
 		 572 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  25.42 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  25.73 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  33.58 
 
 		 669 aa  62  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  26.4 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  25.98 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  24.75 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  25.12 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.97 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  27.01 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  31.91 
 
 		 1685 aa  52  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.12 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.98 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  30.49 
 
 		 226 aa  45.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  25.49 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>