34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1293 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 
127 aa  250  5e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  2.73371e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  60.48 
 
 
125 aa  159  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  61.29 
 
 
125 aa  154  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  62.1 
 
 
125 aa  154  5e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  57.26 
 
 
125 aa  153  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  60.48 
 
 
125 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  58.87 
 
 
125 aa  149  9e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  57.26 
 
 
125 aa  147  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  55.74 
 
 
126 aa  141  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  53.66 
 
 
128 aa  134  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  57.26 
 
 
123 aa  133  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  52 
 
 
128 aa  127  5e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  53.23 
 
 
123 aa  126  1e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  51.2 
 
 
128 aa  123  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  50.4 
 
 
128 aa  123  8e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  50.4 
 
 
128 aa  123  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  56.45 
 
 
124 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  58.06 
 
 
123 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  49.6 
 
 
128 aa  115  2e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  58.06 
 
 
123 aa  112  2e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  53.23 
 
 
133 aa  107  4e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  46.34 
 
 
131 aa  94  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  42.74 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  42.74 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  43.55 
 
 
131 aa  83.2  1e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  44.07 
 
 
127 aa  82.8  2e-15  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  41.13 
 
 
131 aa  82  2e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  40 
 
 
202 aa  79.3  2e-14  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  40.32 
 
 
131 aa  77.8  5e-14  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.94 
 
 
220 aa  68.6  3e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  35.79 
 
 
201 aa  67  9e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  38.54 
 
 
208 aa  59.7  1e-08  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  38.14 
 
 
205 aa  57  9e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70383  Killer toxin Resistant  29.76 
 
 
261 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.650262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>