More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1252 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1252  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
332 aa  668    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.850982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.23 
 
 
333 aa  447  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.62 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0223  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50 
 
 
332 aa  341  9e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.707619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0400  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.9 
 
 
330 aa  332  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.243821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.84 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457574  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0143  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.06 
 
 
331 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.01 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3055  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.58 
 
 
330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2746  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.35 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.15 
 
 
349 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0568  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.25 
 
 
349 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0500  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.85 
 
 
349 aa  285  7e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.927919  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0337  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.06 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.112508  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1625  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.39 
 
 
330 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0810  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.75 
 
 
351 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.128611  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.88 
 
 
343 aa  270  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454531  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3493  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.48 
 
 
333 aa  270  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0433  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0582  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.24 
 
 
340 aa  262  6e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.44 
 
 
345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.36 
 
 
346 aa  235  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.84 
 
 
346 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1984  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.38 
 
 
323 aa  229  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0608348  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.28 
 
 
347 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.89 
 
 
340 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.54 
 
 
346 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.67 
 
 
369 aa  225  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.27 
 
 
336 aa  222  6e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.13 
 
 
348 aa  222  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.62 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.13 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.97 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.43 
 
 
333 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.09 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.17 
 
 
348 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.73 
 
 
350 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.62 
 
 
345 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.49 
 
 
346 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.44 
 
 
346 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.02 
 
 
360 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.76 
 
 
350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.14 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.12 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.58 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1697  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.89 
 
 
322 aa  215  8e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.96 
 
 
341 aa  215  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.16 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06060  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.31 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.24 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.24 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.39 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.1 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0325  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.52 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.94 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0297  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.59 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.99 
 
 
348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.56 
 
 
348 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.81 
 
 
350 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.59 
 
 
333 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.63 
 
 
349 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.44 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.09 
 
 
333 aa  211  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.34 
 
 
345 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0369  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.22 
 
 
346 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1649  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.13 
 
 
347 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1642  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.13 
 
 
347 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.4 
 
 
353 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0271  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.52 
 
 
346 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.84 
 
 
349 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.86 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0998  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.61 
 
 
341 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.92 
 
 
346 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.49 
 
 
347 aa  209  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2617  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.84 
 
 
343 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.167412  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.68 
 
 
348 aa  208  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.13 
 
 
352 aa  208  9e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0283  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.22 
 
 
346 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0142  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.81 
 
 
345 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.3 
 
 
350 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0296  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.22 
 
 
346 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.92 
 
 
346 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0328  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.22 
 
 
346 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.49 
 
 
347 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3499  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.84 
 
 
343 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.13 
 
 
363 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4978  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.62 
 
 
346 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1104  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.57 
 
 
339 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0268  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.22 
 
 
346 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.55 
 
 
351 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.55 
 
 
351 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.15 
 
 
352 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.69 
 
 
350 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.23 
 
 
363 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.49 
 
 
347 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.55 
 
 
351 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.55 
 
 
351 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.12 
 
 
353 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.55 
 
 
351 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.17 
 
 
363 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>