More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1248 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  55.47 
 
 
147 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  53.62 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  51.8 
 
 
148 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  52.17 
 
 
146 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  50 
 
 
147 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  47.68 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  46.04 
 
 
148 aa  133  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  45.19 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 
148 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  44.68 
 
 
154 aa  120  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  41.73 
 
 
148 aa  120  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  44.6 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  43.26 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  46.04 
 
 
165 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  43.88 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
148 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
162 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
149 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  42.45 
 
 
139 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  42.66 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  41.73 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  37.58 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  43.88 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  44.6 
 
 
149 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  39.44 
 
 
149 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
146 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
146 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  40.29 
 
 
149 aa  110  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.73 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  35.37 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  41.43 
 
 
147 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  39.44 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  41.73 
 
 
139 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 
150 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  36.6 
 
 
167 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
152 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
153 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  40.58 
 
 
145 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  47.41 
 
 
152 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
146 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.46 
 
 
150 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  39.86 
 
 
151 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
146 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  38.85 
 
 
150 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
148 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  34.64 
 
 
160 aa  103  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
153 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.95 
 
 
160 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  39.16 
 
 
155 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
147 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  38.85 
 
 
139 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
147 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
147 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  36.81 
 
 
153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  40.43 
 
 
148 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  36.81 
 
 
153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  37.32 
 
 
150 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
149 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
145 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  39.86 
 
 
151 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  39.04 
 
 
150 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  39.57 
 
 
145 aa  101  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  39.57 
 
 
150 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  36.55 
 
 
153 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  38.41 
 
 
149 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  36.11 
 
 
153 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  34.53 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.04 
 
 
146 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.04 
 
 
146 aa  99  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  35.56 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  33.8 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  35.86 
 
 
163 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  41.35 
 
 
181 aa  97.1  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
144 aa  97.1  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  36.55 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  41.55 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  36.55 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  35.97 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  33.1 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  35.57 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>