More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1211 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  64.49 
 
 		 511 aa  679    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  65.83 
 
 		 516 aa  688    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  62.43 
 
 		 513 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  85.06 
 
 		 527 aa  904    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 522 aa  1065    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  74.67 
 
 		 523 aa  776    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  51.01 
 
 		 547 aa  559  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  51.19 
 
 		 547 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  52.09 
 
 		 520 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  52.09 
 
 		 520 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  51.63 
 
 		 516 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  49.04 
 
 		 522 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  50.71 
 
 		 522 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 519 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  49.25 
 
 		 610 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  50.56 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  39.89 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  41.22 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  38.4 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  37.41 
 
 		 499 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  38.4 
 
 		 505 aa  329  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  37.75 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  37.35 
 
 		 574 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  36.47 
 
 		 574 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  36.48 
 
 		 523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  36.48 
 
 		 508 aa  321  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  38.39 
 
 		 496 aa  321  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  37.76 
 
 		 498 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  37.16 
 
 		 574 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  36.13 
 
 		 587 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  37.33 
 
 		 500 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  38.21 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  37.28 
 
 		 498 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  36.52 
 
 		 585 aa  306  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  37.3 
 
 		 814 aa  303  5.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  34.67 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  34.67 
 
 		 501 aa  299  7e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  36.36 
 
 		 815 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  35.04 
 
 		 505 aa  293  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  34.36 
 
 		 504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  37.76 
 
 		 808 aa  287  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  36.87 
 
 		 860 aa  286  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  35.07 
 
 		 526 aa  286  9e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  33.94 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  37.58 
 
 		 816 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  34.67 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  33.45 
 
 		 568 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.46 
 
 		 708 aa  280  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  34.57 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  36.13 
 
 		 822 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  32.83 
 
 		 494 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  34.57 
 
 		 508 aa  270  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  32.76 
 
 		 506 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  34.95 
 
 		 824 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  32.46 
 
 		 523 aa  267  4e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  34.59 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  33.9 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.28 
 
 		 508 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  35.32 
 
 		 873 aa  263  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  32.83 
 
 		 501 aa  263  8e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  32.08 
 
 		 493 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  32.45 
 
 		 501 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  34.53 
 
 		 680 aa  258  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  30.88 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  33.4 
 
 		 891 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  31.95 
 
 		 532 aa  253  7e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  33.2 
 
 		 908 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.26 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  33.79 
 
 		 799 aa  251  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  32.12 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  33.81 
 
 		 498 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.61 
 
 		 497 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.9 
 
 		 503 aa  249  8e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  32.63 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  32.51 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  33.27 
 
 		 526 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  33.52 
 
 		 518 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  33.52 
 
 		 518 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  31.4 
 
 		 847 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  31.74 
 
 		 523 aa  240  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 518 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 518 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  31.78 
 
 		 518 aa  239  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  31.94 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  31.37 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  32.26 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  34.51 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.81 
 
 		 544 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.19 
 
 		 549 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  29.17 
 
 		 528 aa  236  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  29.43 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  28.95 
 
 		 568 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  32.42 
 
 		 521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  29.35 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  30.88 
 
 		 515 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  29.91 
 
 		 564 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  32.08 
 
 		 814 aa  233  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  30.75 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  31.04 
 
 		 809 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  33.13 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>