36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1164 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 
736 aa  1479    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  42.19 
 
 
704 aa  478  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.26 
 
 
824 aa  238  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.43 
 
 
840 aa  234  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.32 
 
 
837 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  39.62 
 
 
836 aa  210  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.3 
 
 
863 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.93 
 
 
891 aa  164  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.1 
 
 
961 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.33 
 
 
872 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  28.75 
 
 
808 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.33 
 
 
1030 aa  118  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  25.62 
 
 
815 aa  112  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.77 
 
 
2073 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.04 
 
 
998 aa  94  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  34.32 
 
 
854 aa  92  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.16 
 
 
884 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  32.35 
 
 
881 aa  87.8  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.71 
 
 
812 aa  83.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  32.24 
 
 
840 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  35 
 
 
868 aa  70.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.18 
 
 
1048 aa  69.7  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.57 
 
 
1045 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2819  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.54 
 
 
754 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  24.02 
 
 
768 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55197  oligosaccharyl transferase  19.64 
 
 
911 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  34.44 
 
 
712 aa  54.3  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0438  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  28.7 
 
 
826 aa  52  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  22.47 
 
 
981 aa  50.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0640  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  29.55 
 
 
731 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  37.62 
 
 
83 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.88 
 
 
853 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.7 
 
 
851 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3096  hypothetical protein  31.58 
 
 
594 aa  44.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.19 
 
 
851 aa  44.7  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  30.12 
 
 
743 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>