78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1132 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1132  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  672  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  51.69 
 
 
339 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  49.24 
 
 
337 aa  314  1e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  30.03 
 
 
327 aa  84.7  2e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.37 
 
 
348 aa  81.6  1e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  31.79 
 
 
334 aa  81.3  2e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  32.84 
 
 
338 aa  80.9  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  25.64 
 
 
349 aa  79  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  32.5 
 
 
365 aa  79  1e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  26.6 
 
 
338 aa  77.8  2e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  27.56 
 
 
336 aa  77.8  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  27.21 
 
 
344 aa  77.4  3e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  26.1 
 
 
347 aa  77.4  3e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  31.18 
 
 
337 aa  77.8  3e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  27.3 
 
 
336 aa  77  4e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
315 aa  76.6  5e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  29.86 
 
 
357 aa  75.5  1e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  27.24 
 
 
337 aa  75.1  1e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  25.4 
 
 
348 aa  75.5  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  26.79 
 
 
328 aa  75.1  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  27.4 
 
 
329 aa  75.5  1e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  25.9 
 
 
328 aa  74.7  2e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  27.54 
 
 
348 aa  75.1  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  25.4 
 
 
390 aa  74.3  3e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  29.67 
 
 
356 aa  74.3  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  28.25 
 
 
319 aa  73.6  4e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  28.5 
 
 
351 aa  73.2  6e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  30.35 
 
 
352 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  27.62 
 
 
371 aa  71.2  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  25 
 
 
330 aa  70.9  3e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  31.32 
 
 
351 aa  70.9  3e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  29.31 
 
 
335 aa  70.9  3e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  25.27 
 
 
328 aa  70.9  3e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  25.94 
 
 
344 aa  70.1  5e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  30.58 
 
 
352 aa  68.9  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  29.84 
 
 
317 aa  68.9  1e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  27.05 
 
 
337 aa  68.9  1e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  29.5 
 
 
345 aa  68.2  2e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  30.1 
 
 
352 aa  68.2  2e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  26.71 
 
 
328 aa  67  5e-10  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  24.01 
 
 
313 aa  65.5  1e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  30.2 
 
 
354 aa  65.1  2e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  27.73 
 
 
314 aa  63.9  4e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  27.52 
 
 
328 aa  63.2  7e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  30.95 
 
 
355 aa  57  4e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  31.48 
 
 
366 aa  56.2  8e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  25.87 
 
 
366 aa  55.8  9e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  25.26 
 
 
375 aa  55.5  1e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  28.14 
 
 
382 aa  55.8  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  26.23 
 
 
332 aa  54.3  3e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  27.66 
 
 
351 aa  53.9  4e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  25.89 
 
 
347 aa  53.1  7e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  26.95 
 
 
383 aa  51.2  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  28.66 
 
 
346 aa  51.6  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  23.53 
 
 
348 aa  51.2  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  28.16 
 
 
350 aa  51.6  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  27.5 
 
 
383 aa  50.8  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  29.47 
 
 
340 aa  50.4  4e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  25.47 
 
 
340 aa  50.4  4e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  27.93 
 
 
362 aa  50.4  4e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  25.27 
 
 
371 aa  50.1  5e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  33.53 
 
 
358 aa  50.1  5e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  24.03 
 
 
348 aa  49.7  6e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  24.74 
 
 
338 aa  49.7  7e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  28.26 
 
 
335 aa  49.7  8e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  25.25 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  25.55 
 
 
335 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.36 
 
 
1017 aa  45.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  27.24 
 
 
338 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  26.01 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  23.17 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  26.25 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  26.75 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 
616 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  24.6 
 
 
340 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  31.01 
 
 
383 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  25.17 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>