More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1066 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  100 
 
 
399 aa  818    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40.9 
 
 
407 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  39.8 
 
 
424 aa  293  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.72 
 
 
408 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  37.97 
 
 
409 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  36.04 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 
250 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  36.29 
 
 
424 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
413 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  32.93 
 
 
425 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  36.39 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
418 aa  225  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.98 
 
 
400 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.5 
 
 
397 aa  224  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  34.33 
 
 
424 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
419 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  33.84 
 
 
428 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  36.2 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  44.77 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  34.05 
 
 
410 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  33.18 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  34.82 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  35.44 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  35.26 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  37.73 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  39.45 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  44.4 
 
 
468 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  35.78 
 
 
427 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  31.91 
 
 
418 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  44.49 
 
 
498 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  40.37 
 
 
422 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  34.2 
 
 
405 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  36.28 
 
 
433 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  38.46 
 
 
419 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  35.2 
 
 
411 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  36.34 
 
 
429 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  41.18 
 
 
429 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  32.6 
 
 
436 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 
390 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  30.98 
 
 
433 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 
440 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  45.04 
 
 
816 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  36.59 
 
 
420 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  32.24 
 
 
711 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  42.8 
 
 
390 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  36.02 
 
 
418 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  41.9 
 
 
420 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  33 
 
 
432 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  41.79 
 
 
411 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  41.37 
 
 
428 aa  206  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  40.32 
 
 
427 aa  206  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  47.45 
 
 
427 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  34.88 
 
 
428 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  31.9 
 
 
455 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  35.33 
 
 
418 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
433 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  34.49 
 
 
410 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  41.84 
 
 
649 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  34.2 
 
 
394 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  38.21 
 
 
427 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  36.76 
 
 
422 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  43.75 
 
 
254 aa  204  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  41.98 
 
 
446 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
431 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  33.42 
 
 
418 aa  202  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  43.28 
 
 
443 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  44.07 
 
 
244 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  39.18 
 
 
493 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  41.8 
 
 
488 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  46.38 
 
 
447 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  38.34 
 
 
435 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  45.58 
 
 
429 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  44.54 
 
 
472 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  32.24 
 
 
437 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  35.84 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.97 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  42.23 
 
 
420 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  49.01 
 
 
369 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 
422 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.74 
 
 
870 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  38.52 
 
 
420 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.66 
 
 
247 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  48.74 
 
 
422 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  44.72 
 
 
430 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  40.84 
 
 
421 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  34.1 
 
 
405 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  35.83 
 
 
457 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  38.15 
 
 
422 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  32.9 
 
 
396 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  45.13 
 
 
456 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.6 
 
 
417 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  43.04 
 
 
264 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  41.84 
 
 
605 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  42.37 
 
 
246 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  42.37 
 
 
242 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 
429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>