40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0958 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
517 aa  1016    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  74.31 
 
 
514 aa  768    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  66.8 
 
 
522 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  56.78 
 
 
519 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  52.41 
 
 
525 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  36.61 
 
 
522 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  33.33 
 
 
506 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 
534 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
505 aa  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
505 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
504 aa  96.3  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 
504 aa  80.1  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 
494 aa  77  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
511 aa  67  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 
499 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 
488 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  20.95 
 
 
516 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 
510 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 
478 aa  47.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 
586 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  22.28 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
488 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  23.32 
 
 
511 aa  44.3  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  20.48 
 
 
591 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
423 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
484 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  22.06 
 
 
484 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
484 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  22.06 
 
 
484 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  22.06 
 
 
484 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  22.01 
 
 
488 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  22.01 
 
 
488 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>