More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0937 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  100 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  52.9 
 
 		 311 aa  305  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  51.26 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  49.44 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  43.22 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  43.07 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  43.66 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  47.06 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  47.23 
 
 		 280 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  46.89 
 
 		 372 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  43.84 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  44.52 
 
 		 303 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  45.96 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  42.75 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  42.75 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  42.8 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  42.16 
 
 		 402 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  41.11 
 
 		 381 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  40.82 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  44.4 
 
 		 360 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  44.24 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  39.7 
 
 		 385 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  41.95 
 
 		 355 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.66 
 
 		 358 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  42.49 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  44.65 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  43.66 
 
 		 359 aa  208  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  44.24 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  43.26 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  43.06 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  42.32 
 
 		 356 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  43.38 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  44.73 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  46.18 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  44.8 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  40.3 
 
 		 359 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 282 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  41.95 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  40.07 
 
 		 371 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  41.42 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.95 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  43.23 
 
 		 366 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  39.03 
 
 		 382 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  40.07 
 
 		 371 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  38.2 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  43.02 
 
 		 359 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  45.38 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  41.42 
 
 		 358 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.93 
 
 		 359 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  43.54 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.33 
 
 		 371 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  40.67 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.66 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.54 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.33 
 
 		 387 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  41.91 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  43.38 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  40.67 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  42.22 
 
 		 355 aa  198  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.28 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.28 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.28 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.28 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.28 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.28 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.28 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  47.23 
 
 		 386 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  43.35 
 
 		 360 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  42.26 
 
 		 359 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  41.45 
 
 		 288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  44.12 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.04 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  44.12 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  41.26 
 
 		 364 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.41 
 
 		 358 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  42.7 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2048  Prephenate dehydratase  44.15 
 
 		 383 aa  194  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  41.64 
 
 		 367 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  41.64 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.91 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  40.59 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  41.64 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.78 
 
 		 358 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.03 
 
 		 358 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  42.96 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.1 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  39.55 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  41.26 
 
 		 364 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  43.96 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  42.91 
 
 		 382 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  44.78 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  43.49 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  39.93 
 
 		 399 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  41.18 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  41.64 
 
 		 365 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  44.28 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  41.26 
 
 		 364 aa  191  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>