67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0935 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0935  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  100 
 
 
509 aa  1033    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0701  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  56.04 
 
 
515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.187582  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1624  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  48.41 
 
 
524 aa  475  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.931737  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1148  GHMP kinase group 1  41.02 
 
 
519 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.820316  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0674  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  48.62 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.2271  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1394  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  48.62 
 
 
325 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.813401  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1282  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  48.62 
 
 
325 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1290  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  46.15 
 
 
325 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0244  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  41.02 
 
 
335 aa  280  6e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1563  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  46.3 
 
 
319 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0806  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  45.03 
 
 
321 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1222  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  45.79 
 
 
318 aa  267  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1345  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  38.98 
 
 
292 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1661  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  33.44 
 
 
310 aa  169  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00577565  normal  0.473342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1616  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  36.14 
 
 
284 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2861  GHMP family kinase  31.25 
 
 
347 aa  163  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480231  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2356  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  34.67 
 
 
322 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37342  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6481  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  33.84 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.321836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2384  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  34.56 
 
 
339 aa  144  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2430  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.24 
 
 
342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100364  normal  0.840747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0527  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  33.94 
 
 
325 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1348  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  36.61 
 
 
326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0110253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6001  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  32.73 
 
 
333 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5777  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  31.31 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1779  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  30.86 
 
 
333 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409011  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5949  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  29.68 
 
 
339 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00300733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2163  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  30.96 
 
 
340 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0673427  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1828  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.96 
 
 
340 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2109  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  34.36 
 
 
328 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3142  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family protein  27.95 
 
 
328 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0626  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  33.56 
 
 
345 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3085  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  26.9 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3535  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 
322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2038  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  32.93 
 
 
333 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172756  normal  0.249661 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2423  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  29.61 
 
 
325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.165612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0128  hypothetical protein  41.03 
 
 
170 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0792  sugar kinase-like protein  32.4 
 
 
310 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2350  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  31.48 
 
 
327 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2606  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  25.25 
 
 
342 aa  97.8  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.614879  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1562  hypothetical protein  36.21 
 
 
171 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.911918  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0579  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  28.86 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.195323  normal  0.392757 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1262  hypothetical protein  37.91 
 
 
173 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1064  hypothetical protein  36.78 
 
 
171 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.618696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0349  hypothetical protein  35.63 
 
 
171 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0595803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1697  hypothetical protein  35.23 
 
 
171 aa  88.2  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3153  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  25.86 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1054  hypothetical protein  34.59 
 
 
168 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1451  GHMP kinase  26.58 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0518145  normal  0.0558976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3957  hypothetical protein  26.51 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1082  GHMP kinase  26.42 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1826  GHMP kinase  21.45 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5298  protein of unknown function DUF98  30.95 
 
 
223 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0556574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3289  hypothetical protein  29.45 
 
 
183 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.677915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3390  hypothetical protein  25.62 
 
 
168 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.00000000204141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0932  GHMP kinase  20.17 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0788  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  25.09 
 
 
359 aa  55.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.128792  hitchhiker  0.00000000549796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12963  hypothetical protein  22.87 
 
 
199 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0091  hypothetical protein  28.3 
 
 
203 aa  50.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0515  hypothetical protein  27.17 
 
 
209 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228468  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2738  sugar kinase-like protein  24.82 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1568  protein of unknown function DUF564  27.33 
 
 
203 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232035  hitchhiker  0.00190267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0050  hypothetical protein  27.16 
 
 
205 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0516  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.53 
 
 
282 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00128664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0529  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.53 
 
 
282 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0171348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0041  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  22.04 
 
 
289 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000358804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0375  protein of unknown function DUF564  27.16 
 
 
201 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1041  hypothetical protein  20.59 
 
 
360 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>