More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0926 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  52.05 
 
 		 243 aa  248  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  48.84 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  46.82 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  42.11 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  42.27 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  45.21 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  43.05 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  42.08 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  39.17 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  38.29 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  40.62 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  40.69 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  36.5 
 
 		 275 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  37.26 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  35.85 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  37.26 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  33.96 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  33.33 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  35.17 
 
 		 358 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  33.19 
 
 		 333 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  33.62 
 
 		 332 aa  108  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  33.19 
 
 		 330 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  32.77 
 
 		 330 aa  105  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  32.34 
 
 		 358 aa  102  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  30.64 
 
 		 324 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  32.05 
 
 		 343 aa  97.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  31.49 
 
 		 324 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  32.47 
 
 		 348 aa  94.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  33.05 
 
 		 358 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  35.42 
 
 		 307 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  31.44 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  34.5 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  28.93 
 
 		 407 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  27.27 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  31.05 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  31.28 
 
 		 329 aa  82  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  30.12 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  28.16 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  30.71 
 
 		 658 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  30.67 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  30.14 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  32 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  27.76 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  27.85 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  31.19 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  29.84 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  30.93 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 312 aa  75.1  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  27.56 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  29.76 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  26.72 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  27.03 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  25.2 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  28.03 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  26.17 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  25 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  25.2 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.68 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  24.8 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  25.2 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  28.76 
 
 		 347 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  24.51 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  26.94 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  26.94 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  25.78 
 
 		 473 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  26.24 
 
 		 476 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  26.29 
 
 		 379 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  37.08 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  25.68 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  25.83 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  29 
 
 		 355 aa  58.2  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0364  DNA repair protein RadA  26.7 
 
 		 423 aa  58.2  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.930824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  26.18 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  26.79 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  25.33 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  26.58 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  26.46 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  25.68 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  26.61 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  27.71 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  25.83 
 
 		 337 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  26.34 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  26.34 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  26.41 
 
 		 344 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  25.83 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.37 
 
 		 456 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  23.74 
 
 		 453 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  27.04 
 
 		 357 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  23.85 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  25.83 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  27.15 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  23.22 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  25 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  28.63 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  27.12 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  26.79 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>