More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0916 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  62.38 
 
 
555 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  61.38 
 
 
542 aa  662    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  62.36 
 
 
543 aa  662    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  100 
 
 
560 aa  1123    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  59.27 
 
 
543 aa  630  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  60.27 
 
 
551 aa  610  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  57.14 
 
 
539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  58.94 
 
 
552 aa  601  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  55.92 
 
 
551 aa  592  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  58.6 
 
 
553 aa  588  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  58.32 
 
 
552 aa  579  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  57.74 
 
 
551 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  54.16 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  53.58 
 
 
542 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  53.19 
 
 
542 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  53.19 
 
 
543 aa  553  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  53.46 
 
 
543 aa  550  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  51.92 
 
 
570 aa  551  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  52.98 
 
 
559 aa  550  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  55.94 
 
 
500 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  53.33 
 
 
553 aa  551  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  52.96 
 
 
563 aa  546  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  54.13 
 
 
558 aa  546  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  53.54 
 
 
547 aa  542  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  51.52 
 
 
557 aa  538  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  50.86 
 
 
545 aa  535  1e-151  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  51.22 
 
 
554 aa  528  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  48.22 
 
 
557 aa  522  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  50.86 
 
 
548 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.43 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  48.06 
 
 
540 aa  515  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  50.19 
 
 
553 aa  514  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.51 
 
 
536 aa  511  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  51.04 
 
 
549 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  51.62 
 
 
554 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  49.42 
 
 
554 aa  502  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  51.24 
 
 
550 aa  504  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.3 
 
 
527 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  47.36 
 
 
559 aa  497  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  50.29 
 
 
558 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  50.19 
 
 
541 aa  497  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  47.68 
 
 
562 aa  493  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  47.53 
 
 
552 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  46.08 
 
 
558 aa  488  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.88 
 
 
529 aa  488  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  48.94 
 
 
560 aa  487  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  48.18 
 
 
558 aa  482  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  49.32 
 
 
554 aa  484  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  49.13 
 
 
553 aa  478  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.17 
 
 
532 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  48.08 
 
 
561 aa  472  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  44.38 
 
 
547 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.36 
 
 
537 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  46.35 
 
 
548 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.94 
 
 
555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  42.88 
 
 
528 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.07 
 
 
519 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.95 
 
 
546 aa  395  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  39.61 
 
 
535 aa  390  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.21 
 
 
528 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.64 
 
 
525 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.62 
 
 
538 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.05 
 
 
525 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  39.92 
 
 
550 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  37.66 
 
 
559 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.83 
 
 
527 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 
567 aa  372  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.2 
 
 
553 aa  360  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.2 
 
 
553 aa  360  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  40.63 
 
 
527 aa  360  5e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  38.23 
 
 
541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.4 
 
 
548 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  39.33 
 
 
551 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  38.65 
 
 
535 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  37.38 
 
 
542 aa  340  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.19 
 
 
529 aa  339  9e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  37.22 
 
 
542 aa  332  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  37.08 
 
 
536 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  38.26 
 
 
553 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  36.78 
 
 
577 aa  330  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.15 
 
 
570 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  38.59 
 
 
558 aa  329  8e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  37.38 
 
 
548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  36.31 
 
 
536 aa  327  5e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  37.62 
 
 
533 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.72 
 
 
560 aa  319  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.08 
 
 
568 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  35.08 
 
 
563 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  35.24 
 
 
552 aa  292  9e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  33.52 
 
 
530 aa  289  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.09 
 
 
531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  34.69 
 
 
539 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.59 
 
 
523 aa  276  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  33.07 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  34.22 
 
 
527 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.33 
 
 
546 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.58 
 
 
541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  34.82 
 
 
534 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  34.82 
 
 
534 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.59 
 
 
526 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>