More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0895 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 558 aa  1107    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  45.41 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  45.55 
 
 		 564 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  41.62 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  40.89 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  45.41 
 
 		 507 aa  350  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  43.09 
 
 		 486 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  37.99 
 
 		 497 aa  296  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  37.99 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  38.08 
 
 		 388 aa  200  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  36.53 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  31.34 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  30.13 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  28.08 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  28.34 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  28.65 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  27.37 
 
 		 735 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  29.41 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  27.99 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  25.54 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  25.84 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  25.42 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  26.35 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  26.35 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  24.95 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  26.21 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  25.92 
 
 		 461 aa  80.1  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  32.96 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  24.73 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  29.27 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  27.55 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  24.86 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  24.81 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  31.23 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  26.89 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  22.55 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  25.07 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  26.11 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  24.11 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  25.35 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  30 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  24.66 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  25.78 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  25.06 
 
 		 531 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  24.82 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  32.79 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.09 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  24.94 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  24.48 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  26.33 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  25.94 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  24.65 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  26.44 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  24.94 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  24.73 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.77 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  24.33 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  24.01 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  22 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  23.51 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  23.6 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  23.6 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  23.97 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  24.95 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  32.24 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 		 413 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  27.54 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  23.54 
 
 		 761 aa  67  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  25.78 
 
 		 530 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0599  protein-export membrane protein SecD  25.91 
 
 		 612 aa  66.2  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.79 
 
 		 530 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  31.87 
 
 		 619 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  24.35 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.56 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  30.24 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  31.47 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.76 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  22.95 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  24.11 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.76 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  31.58 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.48 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  29.84 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  28.27 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.76 
 
 		 754 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  22.16 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  22.16 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  24.52 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  31.09 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  23.24 
 
 		 843 aa  63.9  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  24.75 
 
 		 616 aa  63.9  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.76 
 
 		 754 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.48 
 
 		 754 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.48 
 
 		 754 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.48 
 
 		 754 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>