More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0878 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  36.09 
 
 
1323 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  37.48 
 
 
1442 aa  817    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  39.04 
 
 
1738 aa  884    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  40.57 
 
 
2168 aa  864    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  36.56 
 
 
1504 aa  880    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  38.89 
 
 
1538 aa  900    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  41.48 
 
 
1727 aa  930    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  40.46 
 
 
2110 aa  859    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  40.83 
 
 
1758 aa  865    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  36.69 
 
 
1366 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.29 
 
 
1750 aa  744    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  39.05 
 
 
1579 aa  924    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  38.83 
 
 
1551 aa  927    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  100 
 
 
1812 aa  3713    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  36.25 
 
 
1340 aa  734    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  32.41 
 
 
1318 aa  678    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  34.51 
 
 
1281 aa  595  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  34 
 
 
1281 aa  589  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  33.3 
 
 
1336 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  33.97 
 
 
1300 aa  570  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  30.92 
 
 
1220 aa  538  1e-151  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  31.2 
 
 
1244 aa  539  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  32.43 
 
 
1237 aa  529  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  31.18 
 
 
1426 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  31.35 
 
 
1209 aa  498  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  31.72 
 
 
1194 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1238 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  30.32 
 
 
1212 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  31.74 
 
 
1266 aa  483  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  31.34 
 
 
1207 aa  483  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  29.69 
 
 
1435 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  32.06 
 
 
1222 aa  479  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  30.41 
 
 
1255 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  32.59 
 
 
1206 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1193 aa  477  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.25 
 
 
1266 aa  476  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  38.51 
 
 
1800 aa  475  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  32.47 
 
 
1203 aa  472  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  30.16 
 
 
1406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  31.3 
 
 
1222 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  29.95 
 
 
1196 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.56 
 
 
1258 aa  469  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  32.21 
 
 
1187 aa  469  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  31.75 
 
 
1198 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  29.98 
 
 
1207 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  30.23 
 
 
1293 aa  469  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  31.75 
 
 
1198 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  31.75 
 
 
1198 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.37 
 
 
1192 aa  466  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.79 
 
 
1187 aa  466  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  36.2 
 
 
1801 aa  463  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  30.8 
 
 
1261 aa  459  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  30.34 
 
 
1261 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  29.72 
 
 
1453 aa  460  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  30.18 
 
 
1205 aa  459  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  29.36 
 
 
1444 aa  457  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  29.57 
 
 
1283 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  30.14 
 
 
1199 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  28.21 
 
 
1328 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  29.55 
 
 
1277 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  29.48 
 
 
1300 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  30.09 
 
 
1285 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  30.74 
 
 
1242 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  28.7 
 
 
1297 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  30.09 
 
 
1280 aa  457  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  29.1 
 
 
1330 aa  453  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  29.64 
 
 
1290 aa  452  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  30.28 
 
 
1276 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  30.56 
 
 
1269 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  29.45 
 
 
1298 aa  451  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  29.83 
 
 
1277 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.24 
 
 
1256 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.71 
 
 
1259 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.49 
 
 
1213 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  38.11 
 
 
2065 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  31.65 
 
 
1191 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  29.77 
 
 
1277 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  28.5 
 
 
1267 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  29.13 
 
 
1270 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  28.96 
 
 
1302 aa  443  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  30.35 
 
 
1239 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  31.99 
 
 
1190 aa  443  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  28.95 
 
 
1409 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  30.36 
 
 
1288 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  27.14 
 
 
1329 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  31.47 
 
 
1364 aa  440  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  28.42 
 
 
1247 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  28.69 
 
 
1293 aa  436  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  27.63 
 
 
1336 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  28.73 
 
 
1267 aa  437  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  27.01 
 
 
1328 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  28.88 
 
 
1266 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  27.99 
 
 
1330 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  27.99 
 
 
1330 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  28.41 
 
 
1329 aa  436  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.6 
 
 
1267 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  27.63 
 
 
1335 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.24 
 
 
1263 aa  432  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  28.19 
 
 
1336 aa  431  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  28.91 
 
 
1247 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>